Στις 13 Νοεμβρίου 2005 πραγματοποιήθηκε η ενθρόνιση του νέου Μητροπολίτη Κισάμου & Σελίνου κ. Αμφιλοχίου, εις διαδοχή του παραιτηθέντος Μητροπολίτου Ειρηναίου.
Βαρύ το φορτίο που κληροδοτήθηκε στον νέο Μητροπολίτη από τον απερχόμενο Ειρηναίο που είχε διαγράψει δύο ιδιαίτερα γόνιμες αρχιερατείες στην δυτικότερη Μητρόπολη της Κρήτης (1957 – 1971, 1981 – 2005), με πλούσιο έργο που τον έκανε ιδιαίτερα αγαπητό στην περιοχή.
Ο πήχης ήταν ήδη πολύ ψηλά και ο κ. Αμφιλόχιος κλήθηκε να τον κρατήσει εκεί και -γιατί όχι- να τον βάλει λίγο παραπάνω.
Παίρνοντας τη σκυτάλη μιας ιστορικής Μητρόπολης, ο νέος Μητροπολίτης από την πρώτη μέρα σχεδίασε και εκτέλεσε αρκετά έργα για την εκκλησία, την παιδεία και την κοινωνία. Η δημιουργία του Τσατσαρωνάκειου Πολύκεντρου, που εγκαινιάστηκε στις 4 Σεπτεμβρίου 2012, αποτελεί μέχρι σήμερα την κορωνίδα αυτών των έργων.

Το Πολύκεντρο περιλαμβάνει χώρους εκδηλώσεων, συνεδρίων, ομιλιών, διαλέξεων και σεμιναρίων, βιβλιοθήκης – αναγνωστηρίου, εκμαθήσεως Η/Υ, αγιογραφίας, ψηφιδωτού, φιλοξενίας, κοινωνικά φροντιστήρια, θεατρική ομάδα, φωτογραφική ομάδα, μεταπτυχιακών σπουδών εξ αποστάσεως σε συνεργασία με το Πανεπιστημίου Λευκωσίας Frederick, χώρους ψυχαγωγίας και λειτουργίας του Ωδείου της Μητροπόλεως. Λειτουργούν επίσης: Σχολή γονέων, Συνάξεις νέων «Η Συντροφιά της Χαράς», τηλεοπτικός σταθμός και αίθουσα Βιβλιοπωλείου και Εκδόσεων. Εκτός των ανωτέρω, στόχος είναι ο χώρος αυτός να αποτελέσει έναυσμα και κίνητρο για: Συμπαράσταση εκπαιδευτικών λειτουργών, μελέτη αντιμετωπίσεως κοινωνικών προβλημάτων, επιμορφώσεως κληρικών, καταγραφής Εκκλησιαστικής κληρονομιάς, ως και άλλες δράσεις.
Ο κ. Αμφιλόχιος, με τη στήριξη δωρητών – ευεργετών, δημιούργησε ακόμη το Φαλδάμειο Οίκημα που στεγάζει τα γραφεία της Μητρόπολης, το εκκλησιαστικό βιβλιοπωλείο αλλά και αίθουσα για διάφορες εκδηλώσεις.
Ακόμη, η περαιτέρω ανάπτυξη και αναβάθμιση του Ανουσάκειου Ιδρύματος είναι ανάμεσα στις δράσεις που υλοποιούνται αυτή την 20ετία, αλλά και πολλά άλλα που χαρακτηρίζουν ως ιδιαίτερα θετική την πορεία του κ. Αμφιλοχίου από το 2005 μέχρι σήμερα.

Ποιος είναι
Ο Μητροπολίτης Αμφιλόχιος (κατά κόσμον Αντώνιος Ανδρονικάκης, που γεννήθηκε στα Χανιά το 1964), πραγματοποίησε την εγκύκλιο εκπαίδευσή του στα Χανιά. Σπούδασε Θεολογία στη Θεολογική Σχολή του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης, από όπου αποφοίτησε το 1987. Πραγματοποίησε μεταπτυχιακές σπουδές Δογματικής και Συμβολικής Θεολογίας, στο Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης. Το 1995, ολοκληρώνει επιπλέον μεταπτυχιακές σπουδές στο Πανεπιστήμιο του Κάρντιφ.
Εκάρη μοναχός, το 1990, στην Ιερά Μονή Οδηγητρίας Κυρίας Γωνιάς Χανίων, το 1990 χειροτονείται διάκονος και το 1992 πρεσβύτερος από τον Μητροπολίτη Λάμπης, Συβρίτου καί Σφακίων Ειρηναίο.
Το 1992, ο Οικουμενικός Πατριάρχης Βαρθολομαίος του απένειμε το οφφίκιο του Αρχιμανδρίτη του Οικουμενικού Θρόνου, ενώ την επόμενη χρονιά μετατίθεται στην Ιερά Αρχιεπισκοπή Θυατείρων και Μεγάλης Βρετανίας, όπου υπηρετεί ως ιερατικώς προϊστάμενος του Ιερού Ναού Αγίου Νικολάου Κάρντιφ.
Με την επιστροφή του στην Κρήτη (1995) και για 2 έτη, υπηρετεί ως εφημέριος και ιεροκήρυκας της Μητροπόλεως Λάμπης, Συβρίτου και Σφακίων και το 1997, διορίζεται από τον Μητροπολίτη Κισάμου & Σελίνου Ειρηναίο, εφημέριος Πλατάνου Κισάμου και Πρωτοσύγκελλος της Ιεράς Μητροπόλεως Κισάμου & Σελίνου.
Από το 2003 έως και το 2005, δίδαξε σε σχολεία της δευτεροβάθμιας εκπαίδευσης του Δήμου Κισάμου ενώ διετέλεσε και διευθυντής (σχολάρχης) της Εκκλησιαστικής Σχολής Κρήτης.

Στις 5 Οκτωβρίου 2005 εξελέγη Μητροπολίτης Κισάμου και Σελίνου και χειροτονήθηκε στον Μητροπολιτικό Ναό του Αγίου Μηνά Ηρακλείου τρεις ημέρες αργότερα. Στις 13 Νοεμβρίου 2005 πραγματοποιείται η ενθρόνιση του στην έδρα της Μητρόπολης, στο Καστέλλι.
Το 2021 ήταν υποψήφιος για την Ιερά Αρχιεπισκοπή Κρήτης, στο καταρτισθέν από την Ιερά Επαρχιακή Σύνοδο Κρήτης τριπρόσωπο
Ο Μητροπολίτης Ρεθύμνης και Αυλοποτάμου Ευγένιος με 7 ψήφους, ο Μητροπολίτης Κισάμου και Σελίνου Αμφιλόχιος με 7 ψήφους και ο Μητροπολίτης Πέτρας και Χερρονήσου Γεράσιμος με 5 ψήφους, εξελέγησαν από την Ιερά Επαρχιακή Σύνοδο της Εκκλησίας της Κρήτης ως υποψήφιοι για την θέση του νέου Αρχιεπισκόπου Κρήτης.
Ωστόσο, νέος Αρχιεπίσκοπος Κρήτης αναδείχθηκε ο Μητροπολίτης Ρεθύμνης & Αυλοποτάμου Ευγένιος, μετά από ψηφοφορία κατά τη σημερινή συνεδρίαση της Αγίας και Ιεράς Συνόδου του Οικουμενικού Πατριαρχείου στο Φανάρι.























